Ninja Gaiden III ei ole suoraa jatkoa sarjan kahdelle aiemmalle osalle. Andriasang raportoi Team Ninjan kertoneen Famitsun haastattelussa, että peli kehitetään puhtaalta pöydältä nykypäivän vaatimuksiin.
"Toki arvostamme sarjan menneisyyttä, mutta emme halua sen rajoittavan kolmatta osaa", studiota johtava Yousuke Hayashi perusteli.
Ninja Gaiden III julkistettiin virallisesti syyskuussa Tokyo Game Show'ssa.
Kaksi aiempaa osaa ohjasi Tomonobu Itagaki, joka erosi studiolta vuonna 2008. Hayashi johtaa kolmannen osan kehitystä. Studion mukaan kehitysilmapiiri on vapautuneempi Itagakin lähdön jälkeen.
Team Ninja vahvisti haastattelussa, että Itagakin aikoina paljastetut Dead or Alive: Code Chronus ja Project Progressive on nyt peruttu. Ninja Gaiden III:n ohella studio kehittää Dead or Alive: Dimensionsia ja Ni-ohia.